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【答案】（1）①系统优化要求运用综合的思维方式认识事物，组建生态环境部体现运用综合思维。
②系统优化要求着眼于事物的整体性。保护环境是我国的基本国策，必须重视整体规划和综合治理。
③系统优化要求注意遵循系统内部结构的有序性，注重系统内部结构的优化趋向。整合分散的生态环境保护职责，组建新的生态环境部有利于统一行使生态和城乡各类污染排放监管与行政执法职责，加强环境污染治理，保障国家生态安全，建设美丽中国。
（2）①尊重规律。尊重系统优化规律，整合原各部交叉职责，组建了权责明确的生态环境部、农业农村部、退役军人事务部，理顺了各部门之间的关系。
②充分发挥主观能动性，不断解放思想，与时俱进，用科学理论指导实践。《中共中央关于深化党和国家机构改革的决定》和《深化党和国家机构改革方案》针对以前机构设置和治理体系存在的障碍和弊端，对机构改革作出了整体性、前瞻性和科学性的顶层设计和规划，发挥了巨大的指导作用。
③把发挥主观能动性和尊重规律结合起来。在整体性、前瞻性和科学性的顶层设计和规划的指导下，优化组合了各部门的职能，组建了权责明确的新职能部门，做到了发挥主观能动性和尊重规律相结合。
【解析】
本题以国务院机构改革为背景材料，考查系统优化的方法、一切从实际出发等知识。第（1）问可从系统具有整体性、有序性和内部结构的优化趋向，分析说明组建新的生态环境部是运用综合的思维方式来认识事物，着眼于事物的整体性，遵循了系统内部结构的有序性，注重了系统内部结构的优化趋向，将各部门分散的生态环境保护职责整合起来，有利于统一行使生态和城乡各类污染排放监管与行政执法职责，加强环境污染治理，保障国家生态安全，建设美丽中国；第（2）问可从理顺了各部门之间的关系遵循了客观规律、《决定》和《方案》的出台充分发挥了主观能动性、优化组合了各部门的职能做到了发挥主观能动性和尊重规律相结合等方面，说明是如何做到一切从实际出发的。
（1）本题要求结合材料，运用系统优化的方法，分析说明整合各部门分散的生态环境保护职责、组建新的生态环境部的哲学依据。
从材料可以看出，这次国家机构改革将原环境保护部的职责，国家发展和改革委员会的应对气候变化和减排职责，国土资源部的监督防止地下水污染职责，水利部的编制水功能区划、排污口设置管理、流域水环境保护职责，农业部的监督指导农业面源污染治理职责，国家海洋局的海洋环境保护职责，国务院南水北调工程建设委员会办公室的南水北调工程项目区环境保护职责整合，重构组建生态环境部。可运用系统优化的方法，从系统优化要求运用综合的思维方式认识事物、要求着眼于事物的整体性、注意遵循系统内部结构的有序性、注重系统内部结构的优化趋向等方面，分析说明整合各部门分散的生态环境保护职责、组建新的生态环境部，有利于统一行使生态和城乡各类污染排放监管与行政执法职责，加强环境污染治理，保障国家生态安全，建设美丽中国。
（2）本题要求结合材料，运用生活与哲学知识分析，在新组建生态环境部、农业农村部和退役军人事务部的过程中是如何做到一切从实际从发的。
从材料可以看出，《中共中央关于深化党和国家机构改革的决定》和《深化党和国家机构改革方案》针对以前机构设置和治理体系存在的障碍和弊端，对机构改革作出了整体性、前瞻性和科学性的顶层设计和规划，发挥了巨大的指导作用。整合原各部交叉职责，组建了权责明确的生态环境部、农业农村部、退役军人事务部，理顺了各部门之间的关系。在整体性、前瞻性和科学性的顶层设计和规划的指导下，优化组合了各部门的职能，组建了权责明确的新职能部门，做到了发挥主观能动性和尊重规律相结合。可从尊重系统优化规律、充分发挥主观能动性、把发挥主观能动性和尊重规律结合起来等方面，说明这一过程中是如何做到一切从实际从发的。
