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【答案】D
【解析】解：1号与2号唯一的变量是水分，因此能作为对照实验，可以探究种子萌发的必要条件是水分；
1号与3号唯一的变量是温度，因此能作为对照实验，可以探究种子萌发的必要条件是适宜的温度；
1号与4号唯一的变量是空气，因此能作为对照实验，可以探究种子萌发的必要条件是充足的空气；
2号与3号有两个变量水分和温度，变量不唯一，因此不能作为对照实验；
2号与4号有两个变量水分和空气，变量不唯一，因此不能作为对照实验；
3号与4号有三个变量水分、空气和温度，变量不唯一，因此不能作为对照实验；
所以不能作为对照实验的是2号与3号，2号与4号，3号与4号．
故选：D．
【考点精析】根据题目的已知条件，利用种子萌发的条件和科学探究的过程的相关知识可以得到问题的答案，需要掌握种子的萌发（环境条件：适宜的温度、一定的水分、充足的空气； 自身条件：具有完整的种子和活的胚，已度过休眠期）；科学探究的一般过程：提出问题、做出假设、制定计划、实施计划、得出结论、表达和交流．
