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【答案】B
【解析】解:A、化石是研究生物进化最重要的、最直接的证据,因为化石是保存在岩层中的古生物遗物和生活遗迹.直接说明了古生物的结构或生活习性,A正确.
B、始祖鸟化石的发现,为古代爬行类进化成鸟类提供了典型证据,B错误.
C、原始大气包括水蒸气、氢、氨、甲烷等,与现在大气主要的区别是没有氧气,C正确.
D、经过自然选择也就形成了生物界的多样性,因此决定生物进化方向是自然选择的结果,D正确.
故选:B
【考点精析】本题主要考查了生命起源的化学进化的相关知识点,需要掌握原始大气中的无机物到有机物, 再到原始生命,这一过程是在原始地球上进行才能正确解答此题.