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【答案】 乙 基因 12.5% 一 全为长翅果蝇 一半为长翅，一半为残翅
【解析】（1）“果蝇体细胞内有4对染色体，其形态结构如图一所示”。图甲中，第1对性染色体大小相同，是XX染色体，因此是雌果蝇；图乙中，第1对性染色体大小不同，是XY染色体，因此是雄果蝇。所以图一中乙（选填“甲”或“乙”）表示雄果蝇体细胞。
（2）“果蝇的长翅与残翅是果蝇翅型的不同表现类型”，它是由染色体上的基因控制的。
（3）图二中，亲代都是长翅，子代出现了残翅，表明残翅是隐性性状，长翅是显性性状，因此根据图二的杂交实验可知，残翅是隐性性状。
“用E，e表示控制显、隐性性状的基因”，则长翅的基因组成是EE或Ee，残翅的基因组成是ee。亲代果蝇遗传给子代残翅（ee）果蝇的基因一定是e，因此亲代长翅果蝇的基因组成分别是Ee、Ee，遗传图解如图1：
，
从图1看出，子代个体中出现残翅果蝇的几率是25%。
果蝇的性别遗传图解如图2：
，
从图2看出，子代体中出现雌果蝇的几率是50%%，因此子代个体中出现残翅雌果蝇的几率是25%×50%=12.5%。
（4）“某同学捕捉到一只长翅雄果蝇，为确定该果蝇的基因组成是EE 还是Ee，该同学设计了如下实验方案；
方案①：从图二实验的子代中随机选取一只残翅雌果蝇与该果蝇杂交。
方案②：从图二实验的子代中随机选收一只长翅雌果蝇与该果蝇杂交，长翅是显性性状，基因组成是EE或Ee，残翅是隐性性状，基因组成是ee，因此我认为方案一是可行的，理由是：若杂交后代全为长翅果蝇则该果蝇的基因组成为EE，遗传图解如图3：
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若杂交后代一半为长翅，一半为残翅则该果蝇基因组成为Ee，遗传图解如图4：
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