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【答案】C
【解析】
A、化石在地层中出现的顺序,是人们研究生物进化的一个重要的方面,不同生物化石的出现和地层的形成,有着平行的关系,也就是说,在越古老的地层中,挖掘出的化石所代表的生物,结构越简单,分类地位越低等,水生生物的化石也越多,在距今越近的地层中,挖掘出的化石所代表的生物,结构越复杂,分类地位越高等,陆生生物的化石也越多.这种现象说明了生物是由简单到复杂、由低等到高等、由水生到陆生逐渐进化而来的,另外,科学家还发现在最古老的地层中是没有化石的,说明地球上最初是没有生命的.因此在越晚近的地层中成为化石的生物越复杂,越高等,错误;
B、化石是保存在岩层中的古生物遗物和生活遗迹.直接说明了古生物的结构或生活习性.因此生物进化的直接证据是化石证据,错误;
C、通过对不同生物种类的形态结构进行比较,可以推断它们之间的亲缘关系,正确;
D、从无机小分子到有机小分子得到科学家的证实,其他环节没有得到证实,错误;
所以C选项是正确的