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【答案】D
【解析】
（1）生物的性状是由一对基因控制的，当控制某种性状的一对基因都是显性或一个是显性、一个是隐性时，生物体表现出显性基因控制的性状；当控制某种性状的基因都是隐性时，隐性基因控制的性状才会表现出来。
（2）在一对相对性状的遗传过程中，子代个体中出现了亲代没有的性状，新出现的性状一定是隐性性状，亲代的基因组成是杂合体。
（3）在经常刮大风的海岛上，生活着的昆虫多是无翅或残翅的类型，这是自然选择的结果。由于海岛上经常刮大风，哪些有翅能飞但翅膀不够强大的昆虫，就常常被大风吹到海里，因而生存和繁殖后代的机会较少。而无翅或残翅的昆虫，由于不能飞翔，就不容易被风吹到海里，因而生存和繁殖后代的机会就多。经过一段时间的自然选择之后，经常刮大风的海岛上无翅或残翅的昆虫就特别多。
A、表格中第三组亲代都是长翅，子代出现了残翅，表明残翅是隐性性状，长翅是显性性状，因此据第三组实验判定长翅为显性性状而不是第一组，错误；
B、假设控制长翅的基因是G，控制残翅的基因是g，则长翅的基因型是GG或Gg，残翅的基因型是gg。第三组杂交实验中，亲代长翅果蝇遗传给子代残翅（gg）的基因一定是g，因此亲代长翅果蝇的基因型是Gg，遗传图解如图1：
从图1中看出，子代长翅果蝇的基因型是GG或Gg。
“将第三组的长翅子代和残翅的果蝇进行交配”，遗传图解如图2、图3：
从图2、图3看出，将第三组的长翅子代和残翅的果蝇进行交配，则后代为长翅的几率是50%或100%，而不都是50%，错误；
C、在有风的小岛上，残翅的果蝇飞不起来，不容易被风吹到海里，因此残翅属于有利变异；果蝇的残翅是遗传物质改变引起的变异，因此属于可遗传变异；所以残翅属于有利遗传的变异而不是有利不遗传的变异，错误；
D、果蝇的长翅和残翅是长期自然选择的结果，正确。
故选：D
